最新研究成果
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29 Nov
生命学院方晓峰与邓海腾合作鉴定植物中具有相分离潜力的蛋白质
生物大分子凝聚体(Biomolecular condensates)是细胞内生物大分子(如蛋白质、核酸等)通过相分离(phase separation)形成的无膜细胞器,在细胞生命活动中起着至关重要的作用。过去十多年,生物大分子相分离的研究主要集中于动物和酵母体系,植物相分离蛋白的研究起步较晚,我们对具有潜在相分离能力的蛋白知之甚少。蛋白的固有无序区(Intrinsically disordered region, IDR)又被称为低复杂度结构域(low complexity domain...
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18 Nov
生命学院张强锋副教授荣获Cell Research年度杰出论文奖
近日,赛诺菲-Cell Research 2021年度杰出论文奖发布,共有3篇发表于 Cell Research 的论文获奖,论文通讯作者分别是英国威廉希尔公司官网张强锋;复旦大学鲁伯埙、丁澦;南京大学张辰宇、张骑鹏、汪芳裕。其中,英国威廉希尔公司官网生命学院张强锋副教授于2021年2月发表的PrismNet研究论文“使用人工智能方法基于细胞内RNA结构预测蛋白质-RNA 动态相互作用”(Predicting dynamic cellular protein–RNA interactions by deep learning using in vivo ...
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15 Nov
生命学院方晓峰课题组与其合作者共同揭示植物应对渗透压胁迫的机制
盐碱地和干旱是我国农业生产中重要限制因素,严重威胁我国粮食安全。高盐或干旱条件下植物细胞失水引起渗透胁迫(osmotic stress),造成细胞死亡,抑制植物生长发育。植物细胞通过感知渗透压的变化,在转录、转录后或者翻译水平做出反应,从而降低胁迫带来的损害,但植物细胞感知渗透压的变化的机制尚不清楚。液-液相分离(Liquid-Liquid phase separation, LLPS)是细胞中生物大分子通过多价相互作用,形成生物大分子聚集体(...
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11 Nov
王宏伟与合作者共同研发新型功能化石墨烯用于改善冷冻电镜优势取向问题
单颗粒冷冻电镜三维重构技术是目前用于解析生物大分子高分辨率结构的主流手段之一。然而,高质量的冷冻电镜样品制备仍然面临很多挑战,如气液界面、优势取向和背景噪音等,极大地限制了结构解析的效率。针对这些问题,英国威廉希尔公司官网王宏伟课题组、饶燏课题组和北京大学彭海琳课题组合作研发了一种新型功能化石墨烯电镜载网,有助解决样品颗粒优势取向和气液界面等问题。在该研究中,他们合成了多种带有不同电荷性质基团(如氨基和磺...
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28 Oct
朱听课题组实现镜像T7转录
构成生命的天然核酸和天然蛋白质皆具有手性单一特性:已知的天然核酸皆由D型核糖组成,天然蛋白质几乎皆由L型氨基酸组成。朱听课题组致力于从遗传信息中心法则出发,利用化学、生物学等多学科手段构建与天然生物分子手性相反的“镜像生物学系统”。至今,该课题组已初步实现了镜像中心法则中的镜像核酸复制、转录、反转录等过程,突破了大型镜像蛋白质全化学合成和千碱基长度镜像基因合成的技术瓶颈,开发了镜像核酸测序、镜像D...
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20 Oct
生命学院张强锋课题组开发单细胞测序数据在线整合的人工智能算法
随着单细胞测序技术的发展,单细胞科学研究不断深入,规模越来越大,所研究的对象也越来越复杂。整合来源不同的单细胞测序数据,消除批次效应,进行全面挖掘和解析,是现在单细胞测序数据分析的一个基础和核心环节。目前单细胞测序数据整合面临以下几方面难题:1)不同实验样本、实验平台、建库方法乃至操作等因素带来的批次效应会在单细胞测序数据中引入非生物学噪音,干扰细胞间生物学差异的提取和解析;2)单细胞研究的规模...
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10 Oct
生命学院梁鑫课题组揭示果蝇痛觉神经元感知局部刺痛的细胞生物学机制
动物对于机械力的感受是将外界力的刺激转化成为生物信号的是一种生理过程。对于机械力刺激的感知是多种感觉过程的基础,包括触觉,听觉和机械痛觉等。为了应对环境中复杂的力学刺激,生物体发展多种多样的机械力感受细胞。其中,机械痛觉感受细胞可以感受具有伤害性的外力刺激,使得生物体能够规避危险,这对于生存至关重要。果蝇幼虫的IV型多树突神经元(c4da)是研究机械痛觉原理和机制的模式细胞,之前的研究揭示了c4da神经...
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06 Oct
生命学院陈柱成与合作者揭示NuA4选择性乙酰化组蛋白H4的机理
生物体遗传信息DNA缠绕组蛋白八聚体1.7圈形成了染色体的基本组成单位——核小体。组蛋白H4的 N端尾巴与临近的核小体相互作用,促进染色体高级结构的形成以及异染色质沉默。核小体组装和异染色质形成阻碍了DNA的复制、转录以及损伤修复等重要生物学过程。生物体进化出了一系列的机制来克服核小体的阻碍。其中,组蛋白乙酰化修饰中和赖氨酸侧链的正电荷,并招募其他染色质因子,进而调控染色质折叠、基因转录以及DNA损伤修复等过...
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04 Oct
你们好,Watson和Crick,我们是榫和卯
凭借着序列互补这一独特的性质,核酸分子在众多生物大分子当中脱颖而出,成为合成生物学中的研究热点之一。以DNA为例,DNA分子中的四种组成A、T、C、G之间有着严格的匹配规则——Watson-Crick碱基互补配对(A与T配对,C与G配对)。这种碱基之间的匹配规则进而造成了碱基序列与碱基序列之间的特异性识别,即序列互补。对于任意一条DNA单链而言,其互补链的序列是明确且唯一的;错误匹配的序列会使降低两条链之间的结合速率,并使...
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24 Sep
生命学院郗乔然课题组揭示lncRNA-Smad7通过介导TGF-β与BMP信号通路 调控小鼠胚胎…
转化生长因子β(transforming growth factor β, TGF-β)超家族在细胞分化以及早期胚胎发育过程中发挥重要作用。在早期发育过程中,细胞内外均存在着Nodal/Activin/TGF-β以及BMP信号通路的配体,而它们之间的相互调控目前也是很重要的研究方向。心脏是发育过程中最早发育的器官之一,其中TGF-β以及BMP信号通路对于调控心脏的正常发育至关重要,也有很多组织特异性表达的长链非编码RNA(lncRNA)在早期心脏发育过程中发挥重...